[][] dre  tubb6 Gene
functional annotation
Function   tubulin, beta 6 class V
GO BP
GO:0000226 [list] [network] microtubule cytoskeleton organization  (322 genes)  IBA  
GO:0000278 [list] [network] mitotic cell cycle  (328 genes)  IBA  
GO:0007017 [list] [network] microtubule-based process  (494 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005874 [list] [network] microtubule  (249 genes)  IBA IEA  
GO:0005856 [list] [network] cytoskeleton  (1239 genes)  IEA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (7473 genes)  IBA IEA  
GO MF
GO:0005200 [list] [network] structural constituent of cytoskeleton  (40 genes)  IBA IEA  
GO:0003924 [list] [network] GTPase activity  (341 genes)  IEA  
GO:0005525 [list] [network] GTP binding  (497 genes)  IBA IEA  
GO:0000166 [list] [network] nucleotide binding  (2320 genes)  IEA  
KEGG dre04145 [list] [network] Phagosome (185 genes)
dre04540 [list] [network] Gap junction (132 genes)
dre05132 [list] [network] Salmonella infection (332 genes)
Protein NP_001017762.2  NP_001315430.1 
BLAST NP_001017762.2  NP_001315430.1 
Orthologous [Ortholog page] TUBB2A (hsa)TUBB3 (hsa)TUBB4A (hsa)TUBB4B (hsa)Tubb2a (mmu)Tubb3 (mmu)Tubb4a (mmu)Tubb5 (mmu)Tubb4a (rno)Tubb5 (rno)betaTub56D (dme)betaTub60D (dme)betaTub85D (dme)betaTub97EF (dme)Tubb6 (mmu)Tubb2b (mmu)TUBB1 (hsa)TUBB6 (hsa)CG32396 (dme)ben-1 (cel)tbb-2 (cel)tbb-1 (cel)tbb-6 (cel)mec-7 (cel)tbb-4 (cel)TUBB (hsa)Tubb4b (mmu)Tubb3 (rno)TUBB8B (hsa)Tubb2b (rno)Tubb4b (rno)Tubb6 (rno)zgc:65894 (dre)tubb4b (dre)TUBB8 (hsa)TUBB2B (hsa)tubb5 (dre)TUBB (gga)TUBB1 (gga)zgc:55461 (dre)TUBB4B (gga)TUBB2B (gga)TUBB6 (gga)TUBB3 (gga)TUBB (cfa)TUBB2A (cfa)LOC478702 (cfa)LOC478825 (cfa)TUBB6 (cfa)TUBB1 (cfa)LOC491231 (cfa)Tubb2a (rno)Tubb1 (mmu)tubb2 (dre)tubb1 (dre)TUBB (mcc)tubb2b (dre)zgc:123292 (dre)Tubb1 (rno)TUBB1 (mcc)TUBB4A (mcc)TUBB2B (mcc)LOC708952 (mcc)TUBB8 (mcc)LOC712533 (mcc)LOC720677 (mcc)LOC722862 (mcc)LOC722929 (mcc)tubb4bl (dre)zgc:153264 (dre)TUBB2A (gga)TUB2 (sce)nda3 (spo)TUBB1 (fca)TUBB4B (mcc)TUBB4A (cfa)TUBB4B (fca)TUBB2B (fca)TUBB4A (fca)LOC101090736 (fca)TUBB (fca)TUBB6 (fca)TUBB4B (cfa)TUBB3 (cfa)LOC106996033 (mcc)TUBB2A (fca)LOC114672640 (mcc)TUBB6 (mcc)
Subcellular
localization
wolf
cyto_nucl 4,  cyto 4,  nucl 3,  pero 2,  extr 1  (predict for NP_001017762.2)
cyto 4,  cyto_nucl 3,  nucl 1,  extr 1,  mito 1,  pero 1,  mito_pero 1  (predict for NP_001315430.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with tubb6 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
5.3 crybb1l1 crystallin, beta B1, like 1 [detail] 553473
5.3 mipb major intrinsic protein of lens fiber b [detail] 553420
5.2 gja3 gap junction protein, alpha 3 [detail] 387533
5.0 si:ch211-214j24.14 si:ch211-214j24.14 [detail] 559160
4.8 LOC100002134 zinc/cadmium resistance protein-like [detail] 100002134
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for tubb6]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Tissue specificity*
Link to other DBs
Entrez Gene ID 550458    
Refseq ID (protein) NP_001017762.2 
NP_001315430.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].