[][] gga  TNC Gene
functional annotation
Function   tenascin C
GO BP
GO:0007155 [list] [network] cell adhesion  (114 genes)  IBA  
GO:0042127 [list] [network] regulation of cell population proliferation  (158 genes)  IEA  
GO CC
GO:0062023 [list] [network] collagen-containing extracellular matrix  (43 genes)  IBA  
GO:0005615 [list] [network] extracellular space  (233 genes)  IBA  
GO MF
GO:0005102 [list] [network] signaling receptor binding  (168 genes)  IBA  
KEGG gga04510 [list] [network] Focal adhesion (191 genes)
gga04512 [list] [network] ECM-receptor interaction (84 genes)
Protein NP_990787.2  XP_040504894.1  XP_040504896.1  XP_040504897.1  XP_040504898.1  XP_040504899.1  XP_040504900.1  XP_040504901.1  XP_040504902.1  XP_040504903.1  XP_040504904.1  XP_040504905.1  XP_040504906.1  XP_040504907.1  XP_040504908.1  XP_040504909.1  XP_040504910.1  XP_040504911.1  XP_040504912.1  XP_040504913.1 
BLAST NP_990787.2  XP_040504894.1  XP_040504896.1  XP_040504897.1  XP_040504898.1  XP_040504899.1  XP_040504900.1  XP_040504901.1  XP_040504902.1  XP_040504903.1  XP_040504904.1  XP_040504905.1  XP_040504906.1  XP_040504907.1  XP_040504908.1  XP_040504909.1  XP_040504910.1  XP_040504911.1  XP_040504912.1  XP_040504913.1 
Orthologous [Ortholog page] TNC (hsa)Tnc (mmu)Tnc (rno)TNC (cfa)TNC (mcc)zmp:0000000846 (dre)TNC (fca)
Subcellular
localization
wolf
extr 8,  pero 1  (predict for NP_990787.2)
extr 8,  pero 1,  E.R. 1,  mito_pero 1  (predict for XP_040504894.1)
extr 8,  pero 1,  E.R. 1,  mito_pero 1  (predict for XP_040504896.1)
extr 8,  pero 1,  E.R. 1,  mito_pero 1  (predict for XP_040504897.1)
extr 8,  pero 1,  E.R. 1,  mito_pero 1  (predict for XP_040504898.1)
extr 8,  pero 1,  E.R. 1,  mito_pero 1  (predict for XP_040504899.1)
extr 8,  pero 1,  E.R. 1,  mito_pero 1  (predict for XP_040504900.1)
extr 8,  pero 1,  E.R. 1,  mito_pero 1  (predict for XP_040504901.1)
extr 8,  E.R. 1,  pero 1  (predict for XP_040504902.1)
extr 8,  pero 1  (predict for XP_040504903.1)
extr 8,  pero 1  (predict for XP_040504904.1)
extr 8,  E.R. 1,  pero 1  (predict for XP_040504905.1)
extr 8,  pero 1  (predict for XP_040504906.1)
extr 6,  E.R. 2,  mito 1,  lyso 1  (predict for XP_040504907.1)
extr 8,  E.R. 1,  pero 1  (predict for XP_040504908.1)
extr 8,  pero 1  (predict for XP_040504909.1)
extr 8,  E.R. 1,  pero 1  (predict for XP_040504910.1)
extr 8,  E.R. 1,  pero 1  (predict for XP_040504911.1)
extr 8,  pero 1  (predict for XP_040504912.1)
extr 8,  E.R. 1,  pero 1  (predict for XP_040504913.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
gga04510 Focal adhesion 5
gga04512 ECM-receptor interaction 5
gga04350 TGF-beta signaling pathway 3
gga04145 Phagosome 2
Genes directly connected with TNC on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
7.5 COL12A1 collagen type XII alpha 1 chain [detail] 395875
5.4 THBS1 thrombospondin 1 [detail] 373987
4.7 TGFBI transforming growth factor beta induced [detail] 395897
4.0 C1QTNF3 C1q and TNF related 3 [detail] 427430
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for TNC]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Tissue specificity*
Link to other DBs
Entrez Gene ID 396440    
Refseq ID (protein) NP_990787.2 
XP_040504894.1 
XP_040504896.1 
XP_040504897.1 
XP_040504898.1 
XP_040504899.1 
XP_040504900.1 
XP_040504901.1 
XP_040504902.1 
XP_040504903.1 
XP_040504904.1 
XP_040504905.1 
XP_040504906.1 
XP_040504907.1 
XP_040504908.1 
XP_040504909.1 
XP_040504910.1 
XP_040504911.1 
XP_040504912.1 
XP_040504913.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].